Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Speer3W4VSP1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer3W4VSP1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer3W4VSP1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer3W4VSP1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms