Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms