Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rlbp1Q9Z275 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rlbp1Q9Z275 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rlbp1Q9Z275 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms