Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Uso1Q9Z1Z0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uso1Q9Z1Z0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uso1Q9Z1Z0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uso1Q9Z1Z0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms