Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
D17h6s53eQ9Z1R4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
D17h6s53eQ9Z1R4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D17h6s53eQ9Z1R4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
D17h6s53eQ9Z1R4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
D17h6s53eQ9Z1R4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
D17h6s53eQ9Z1R4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
D17h6s53eQ9Z1R4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
D17h6s53eQ9Z1R4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
D17h6s53eQ9Z1R4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms