Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nek4Q9Z1J2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek4Q9Z1J2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nek4Q9Z1J2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 579.7 ms