Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog1Q9Z160 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog1Q9Z160 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog1Q9Z160 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cog1Q9Z160 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cog1Q9Z160 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms