Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne6Q9Z140 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne6Q9Z140 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne6Q9Z140 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms