Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfdn5Q9WU28 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn5Q9WU28 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms