Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptpn4Q9WU22 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn4Q9WU22 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn4Q9WU22 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms