Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn8aQ9WTU3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn8aQ9WTU3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Scn8aQ9WTU3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn8aQ9WTU3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms