Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf2Q9WTU0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf2Q9WTU0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf2Q9WTU0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf2Q9WTU0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf2Q9WTU0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf2Q9WTU0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf2Q9WTU0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf2Q9WTU0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf2Q9WTU0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf2Q9WTU0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Phf2Q9WTU0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf2Q9WTU0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf2Q9WTU0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf2Q9WTU0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf2Q9WTU0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf2Q9WTU0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms