Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TapbpQ9R233 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TapbpQ9R233 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.7 ms