Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NbnQ9R207 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NbnQ9R207 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NbnQ9R207 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NbnQ9R207 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms