Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpxQ9R0M3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpxQ9R0M3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpxQ9R0M3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms