Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkab1Q9R078 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkab1Q9R078 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms