Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CtsfQ9R013 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CtsfQ9R013 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtsfQ9R013 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtsfQ9R013 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms