Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms