Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Usp21Q9QZL6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp21Q9QZL6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp21Q9QZL6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms