Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ercc4Q9QZD4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc4Q9QZD4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ercc4Q9QZD4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ercc4Q9QZD4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms