Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan3Q9QY33 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tspan3Q9QY33 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tspan3Q9QY33 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan3Q9QY33 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan3Q9QY33 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms