Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copg2Q9QXK3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Copg2Q9QXK3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copg2Q9QXK3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copg2Q9QXK3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copg2Q9QXK3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms