Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpc5Q9QX29 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpc5Q9QX29 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpc5Q9QX29 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Trpc5Q9QX29 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms