Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdkl2Q9QUK0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdkl2Q9QUK0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.1 ms