Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RhoaQ9QUI0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RhoaQ9QUI0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RhoaQ9QUI0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RhoaQ9QUI0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RhoaQ9QUI0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RhoaQ9QUI0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RhoaQ9QUI0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms