Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AatfQ9JKX4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AatfQ9JKX4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AatfQ9JKX4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms