Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nectin1Q9JKF6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nectin1Q9JKF6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms