Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpa33Q9JKA5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpa33Q9JKA5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms