Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msgn1Q9JK54 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msgn1Q9JK54 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msgn1Q9JK54 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Msgn1Q9JK54 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms