Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Efcc1Q9JJF6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Efcc1Q9JJF6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Efcc1Q9JJF6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Efcc1Q9JJF6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Efcc1Q9JJF6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms