Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cog8Q9JJA2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cog8Q9JJA2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms