Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmbr1Q9JIT0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms