Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc40a1Q9JHI9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc40a1Q9JHI9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc40a1Q9JHI9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms