Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ube3bQ9ES34 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ube3bQ9ES34 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ube3bQ9ES34 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ube3bQ9ES34 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms