Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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