Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrnb2Q9ERK7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chrnb2Q9ERK7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrnb2Q9ERK7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chrnb2Q9ERK7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrnb2Q9ERK7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrnb2Q9ERK7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrnb2Q9ERK7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrnb2Q9ERK7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrnb2Q9ERK7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms