Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ripk4Q9ERK0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk4Q9ERK0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ripk4Q9ERK0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms