Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI2

Rab27a, Ras-related protein Rab-27A, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27aQ9ERI2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab27aQ9ERI2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab27aQ9ERI2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab27aQ9ERI2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms