Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn12Q9ER56 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn12Q9ER56 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms