Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clstn1Q9EPL2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clstn1Q9EPL2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clstn1Q9EPL2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms