Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv4Q9EPK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv4Q9EPK8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpv4Q9EPK8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv4Q9EPK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms