Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsc1Q9EP53 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsc1Q9EP53 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms