Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrotQ9DC50 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CrotQ9DC50 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CrotQ9DC50 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms