Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csnk1dQ9DC28 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk1dQ9DC28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk1dQ9DC28 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csnk1dQ9DC28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms