Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ftsj3Q9DBE9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ftsj3Q9DBE9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms