Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg9Q9DB90 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smg9Q9DB90 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg9Q9DB90 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms