Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp12Q9D9M2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp12Q9D9M2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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