Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700109H08RikQ9D9C0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
1700109H08RikQ9D9C0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700109H08RikQ9D9C0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700109H08RikQ9D9C0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700109H08RikQ9D9C0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
1700109H08RikQ9D9C0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700109H08RikQ9D9C0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700109H08RikQ9D9C0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700109H08RikQ9D9C0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700109H08RikQ9D9C0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700109H08RikQ9D9C0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms