Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx5Q9D8U8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx5Q9D8U8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms