Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms